El programa de la Maestría en Ciencias (Hidrología), cuenta con becas CONACYT y con becas propias de la Institución. Eventualmente se otorgan becas por apoyo a trabajos del laboratorio (servicios especializados). Algunas veces se ofrecen becas internas obtenidas de proyectos institucionales de apoyo a la investigación cuyas convocatorias aparecen convocadas en línea. Cabe mencionar que la UAQ tiene programas de investigación que se incluyen dentro del financiamiento de las becas principalmente a nuestros estudiantes.