Una parte fundamental del trabajo de la Maestría será su vinculación con la investigación (existente y la que se puede desarrollar al interior del programa), pues esto es un elemento necesario para alcanzar los objetivos del programa y será un medio para su funcionamiento adecuado.

En este sentido, la línea general de generación y aplicación del conocimiento es lo relativo a la enseñanza de la Didáctica en las Ciencias. Sin embargo, ésta es un área de conocimiento y desarrollo muy amplia, por lo que conviene acotarla a fin de organizar de una manera más efectiva el proceso educativo en la Maestría. Por lo tanto, la línea de generación y aplicación del conocimiento es:

Desarrollo de contenidos y nuevos ambientes de enseñanza/aprendizaje